NetBSD comprens un système d'émulation qui permet à un portage donné de lancer des programmes compilés pour un autre système d'exploitation. Les émulations gérées varient suivant le processeur.
La collection de paquetages de NetBSD est la plus simple méthode pour installer des centaines de logiciels. Elle se charge elle-même de l'installation des bibliothèques et des modules dont peut avoir besoin un programme.
La plupart des logiciels Unix peuvent être téléchargés, compilés et installés comme avec tout système Unix. Ce n'est pas aussi simple qu'avec le système de paquetages mais c'est relativement facile.